Por su estratégica ubicación geográfica a lo largo de la historia el Comando Aéreo de Combate No.6 ha sido una Unidad Militar fundamental en el desarrollo de operaciones contra el narcotráfico, la minería ilegal y la lucha contra los grupos armados ilegales; ha trabajado articuladamente con entidades que buscan la conservación del medio ambiente y a través de campañas cívicas sociales en el esfuerzo no armado, ha beneficiado a comunidades y resguardos indígenas.

